Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
TREX1Q9NSU2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TREX1Q9NSU2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TREX1Q9NSU2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TREX1Q9NSU2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms