Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SNX15Q9NRS6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX15Q9NRS6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms