Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRMS1Q9HCU9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms