Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ELL3Q9HB65 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELL3Q9HB65 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms