Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CLSPNQ9HAW4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CLSPNQ9HAW4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms