Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9T3

ELP3, Elongator complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP3Q9H9T3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ELP3Q9H9T3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ELP3Q9H9T3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ELP3Q9H9T3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ELP3Q9H9T3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ELP3Q9H9T3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ELP3Q9H9T3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ELP3Q9H9T3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ELP3Q9H9T3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ELP3Q9H9T3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ELP3Q9H9T3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ELP3Q9H9T3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ELP3Q9H9T3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ELP3Q9H9T3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ELP3Q9H9T3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ELP3Q9H9T3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms