Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRKRIP1Q9H875 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKRIP1Q9H875 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms