Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYNCQ9H7C4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYNCQ9H7C4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms