Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPAP3Q9H6T3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPAP3Q9H6T3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms