Protein–RNA interactions for Protein: Q9H190

SDCBP2, Syntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2Q9H190 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SDCBP2Q9H190 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms