Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H5

ARHGAP39, Rho GTPase-activating protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP39Q9C0H5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP39Q9C0H5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP39Q9C0H5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms