Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA4CQ9C0C4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms