Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PUS3Q9BZE2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PUS3Q9BZE2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms