Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 TTTY14-204ENST00000452584 860 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms