Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC020910.4-201ENST00000612269 540 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms