Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GSDMCQ9BYG8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms