Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms