Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC8Q9BY41 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC8Q9BY41 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC8Q9BY41 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC8Q9BY41 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC8Q9BY41 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC8Q9BY41 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC8Q9BY41 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC8Q9BY41 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC8Q9BY41 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC8Q9BY41 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC8Q9BY41 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC8Q9BY41 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC8Q9BY41 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC8Q9BY41 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDAC8Q9BY41 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDAC8Q9BY41 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDAC8Q9BY41 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDAC8Q9BY41 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDAC8Q9BY41 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDAC8Q9BY41 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDAC8Q9BY41 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDAC8Q9BY41 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDAC8Q9BY41 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDAC8Q9BY41 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HDAC8Q9BY41 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDAC8Q9BY41 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HDAC8Q9BY41 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDAC8Q9BY41 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDAC8Q9BY41 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDAC8Q9BY41 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDAC8Q9BY41 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC8Q9BY41 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC8Q9BY41 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC8Q9BY41 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC8Q9BY41 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC8Q9BY41 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC8Q9BY41 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC8Q9BY41 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC8Q9BY41 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC8Q9BY41 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC8Q9BY41 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC8Q9BY41 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC8Q9BY41 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC8Q9BY41 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC8Q9BY41 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC8Q9BY41 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC8Q9BY41 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC8Q9BY41 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC8Q9BY41 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC8Q9BY41 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC8Q9BY41 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC8Q9BY41 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HDAC8Q9BY41 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms