Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PACSIN1Q9BY11 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN1Q9BY11 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms