Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms