Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS2Q9BXC9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BBS2Q9BXC9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
BBS2Q9BXC9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BBS2Q9BXC9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BBS2Q9BXC9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BBS2Q9BXC9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BBS2Q9BXC9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BBS2Q9BXC9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BBS2Q9BXC9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BBS2Q9BXC9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BBS2Q9BXC9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BBS2Q9BXC9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BBS2Q9BXC9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BBS2Q9BXC9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BBS2Q9BXC9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BBS2Q9BXC9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BBS2Q9BXC9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms