Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SYCP2Q9BX26 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SYCP2Q9BX26 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SYCP2Q9BX26 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
SYCP2Q9BX26 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SYCP2Q9BX26 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SYCP2Q9BX26 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SYCP2Q9BX26 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SYCP2Q9BX26 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SYCP2Q9BX26 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SYCP2Q9BX26 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SYCP2Q9BX26 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SYCP2Q9BX26 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SYCP2Q9BX26 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SYCP2Q9BX26 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SYCP2Q9BX26 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SYCP2Q9BX26 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SYCP2Q9BX26 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SYCP2Q9BX26 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SYCP2Q9BX26 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SYCP2Q9BX26 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SYCP2Q9BX26 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SYCP2Q9BX26 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SYCP2Q9BX26 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SYCP2Q9BX26 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SYCP2Q9BX26 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SYCP2Q9BX26 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYCP2Q9BX26 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYCP2Q9BX26 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYCP2Q9BX26 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYCP2Q9BX26 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYCP2Q9BX26 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYCP2Q9BX26 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYCP2Q9BX26 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYCP2Q9BX26 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYCP2Q9BX26 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYCP2Q9BX26 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
SYCP2Q9BX26 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
SYCP2Q9BX26 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYCP2Q9BX26 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYCP2Q9BX26 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
SYCP2Q9BX26 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYCP2Q9BX26 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYCP2Q9BX26 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYCP2Q9BX26 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYCP2Q9BX26 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYCP2Q9BX26 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SYCP2Q9BX26 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SYCP2Q9BX26 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SYCP2Q9BX26 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SYCP2Q9BX26 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms