Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB2BQ9BVA1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms