Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PAGR1Q9BTK6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAGR1Q9BTK6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms