Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
MCMBPQ9BTE3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MCMBPQ9BTE3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MCMBPQ9BTE3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MCMBPQ9BTE3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MCMBPQ9BTE3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MCMBPQ9BTE3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MCMBPQ9BTE3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
MCMBPQ9BTE3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MCMBPQ9BTE3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MCMBPQ9BTE3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MCMBPQ9BTE3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MCMBPQ9BTE3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MCMBPQ9BTE3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MCMBPQ9BTE3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MCMBPQ9BTE3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MCMBPQ9BTE3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
MCMBPQ9BTE3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MCMBPQ9BTE3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MCMBPQ9BTE3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MCMBPQ9BTE3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MCMBPQ9BTE3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MCMBPQ9BTE3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MCMBPQ9BTE3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MCMBPQ9BTE3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MCMBPQ9BTE3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MCMBPQ9BTE3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MCMBPQ9BTE3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MCMBPQ9BTE3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MCMBPQ9BTE3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MCMBPQ9BTE3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MCMBPQ9BTE3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MCMBPQ9BTE3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MCMBPQ9BTE3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MCMBPQ9BTE3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MCMBPQ9BTE3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MCMBPQ9BTE3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MCMBPQ9BTE3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
MCMBPQ9BTE3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MCMBPQ9BTE3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MCMBPQ9BTE3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
MCMBPQ9BTE3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MCMBPQ9BTE3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MCMBPQ9BTE3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MCMBPQ9BTE3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MCMBPQ9BTE3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MCMBPQ9BTE3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms