Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TIMM29Q9BSF4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TIMM29Q9BSF4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMM29Q9BSF4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMM29Q9BSF4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMM29Q9BSF4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMM29Q9BSF4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMM29Q9BSF4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMM29Q9BSF4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMM29Q9BSF4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMM29Q9BSF4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMM29Q9BSF4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMM29Q9BSF4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMM29Q9BSF4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMM29Q9BSF4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMM29Q9BSF4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMM29Q9BSF4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMM29Q9BSF4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMM29Q9BSF4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMM29Q9BSF4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMM29Q9BSF4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMM29Q9BSF4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMM29Q9BSF4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMM29Q9BSF4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMM29Q9BSF4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMM29Q9BSF4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMM29Q9BSF4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TIMM29Q9BSF4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMM29Q9BSF4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMM29Q9BSF4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMM29Q9BSF4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMM29Q9BSF4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMM29Q9BSF4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMM29Q9BSF4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMM29Q9BSF4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMM29Q9BSF4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMM29Q9BSF4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMM29Q9BSF4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMM29Q9BSF4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMM29Q9BSF4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMM29Q9BSF4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMM29Q9BSF4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMM29Q9BSF4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMM29Q9BSF4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMM29Q9BSF4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMM29Q9BSF4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TIMM29Q9BSF4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms