Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM175Q9BSA9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM175Q9BSA9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM175Q9BSA9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM175Q9BSA9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM175Q9BSA9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM175Q9BSA9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM175Q9BSA9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM175Q9BSA9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM175Q9BSA9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM175Q9BSA9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM175Q9BSA9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM175Q9BSA9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMEM175Q9BSA9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM175Q9BSA9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM175Q9BSA9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM175Q9BSA9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM175Q9BSA9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM175Q9BSA9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM175Q9BSA9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM175Q9BSA9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM175Q9BSA9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM175Q9BSA9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM175Q9BSA9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM175Q9BSA9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM175Q9BSA9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM175Q9BSA9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM175Q9BSA9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM175Q9BSA9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM175Q9BSA9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM175Q9BSA9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMEM175Q9BSA9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM175Q9BSA9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM175Q9BSA9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM175Q9BSA9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms