Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDF4Q9BRK5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms