Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RHOXF2Q9BQY4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms