Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
RETNLBQ9BQ08 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms