Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VGLL1Q99990 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms