Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CITED2Q99967 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CITED2Q99967 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms