Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
DUSP9Q99956 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP9Q99956 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms