Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAT1Q99536 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms