Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRBNQ96SW2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms