Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TSPAN18Q96SJ8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN18Q96SJ8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN18Q96SJ8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN18Q96SJ8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN18Q96SJ8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN18Q96SJ8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN18Q96SJ8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN18Q96SJ8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN18Q96SJ8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN18Q96SJ8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN18Q96SJ8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN18Q96SJ8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN18Q96SJ8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN18Q96SJ8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN18Q96SJ8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN18Q96SJ8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN18Q96SJ8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN18Q96SJ8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN18Q96SJ8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN18Q96SJ8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN18Q96SJ8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN18Q96SJ8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN18Q96SJ8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN18Q96SJ8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN18Q96SJ8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN18Q96SJ8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN18Q96SJ8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN18Q96SJ8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN18Q96SJ8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN18Q96SJ8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN18Q96SJ8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN18Q96SJ8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN18Q96SJ8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN18Q96SJ8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN18Q96SJ8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN18Q96SJ8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN18Q96SJ8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN18Q96SJ8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN18Q96SJ8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN18Q96SJ8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN18Q96SJ8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN18Q96SJ8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN18Q96SJ8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN18Q96SJ8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms