Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CRAMP1Q96RY5 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms