Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF13CQ96RJ3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF13CQ96RJ3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF13CQ96RJ3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF13CQ96RJ3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF13CQ96RJ3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF13CQ96RJ3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF13CQ96RJ3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF13CQ96RJ3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms