Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SAMD11Q96NU1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD11Q96NU1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms