Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C8orf49Q96NF6 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C8orf49Q96NF6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C8orf49Q96NF6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C8orf49Q96NF6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C8orf49Q96NF6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms