Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF4

CCDC140, Coiled-coil domain-containing protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC140Q96MF4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC140Q96MF4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC140Q96MF4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC140Q96MF4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC140Q96MF4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC140Q96MF4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC140Q96MF4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC140Q96MF4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC140Q96MF4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC140Q96MF4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC140Q96MF4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms