Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD8Q96LT4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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