Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPGRIP1Q96KN7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms