Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDLIM2Q96JY6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDLIM2Q96JY6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms