Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms