Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC34Q96HJ3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC34Q96HJ3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms