Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms