Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDC3Q96F86 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDC3Q96F86 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms