Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
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