Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
FRAT1Q92837 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FRAT1Q92837 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms